Jeg tog 9 forskellige kommercielle DNA-tests og fik 6 forskellige resultater

  • Vova Krasen
  • 0
  • 3031
  • 123

Sagen ved mig er, at jeg er jødisk. Det er ikke det eneste ved mig. Jeg er også 5 fod 11 tommer høj, en brille iført cykling. Men de fleste mennesker, der kender mig, ville sandsynligvis ikke blive overrasket over at få at vide, at de fleste af mine forfædre boede i shtetls i Østeuropa.

Så det var ikke for overraskende, da jeg sendte ni DNA-prøver til tre forskellige DNA-virksomheder under en række falske navne, og resultaterne indikerede, at jeg er superduper Ashkenazi jødisk. (Ashkenazim er jøder, der sporer deres forfader tilbage til jiddisk-talende befolkninger, der beboer regionen mellem Frankrig og Rusland.)

Her var dog lidt overraskende: Ingen af ​​virksomhederne - AncestryDNA, 23andMe og National Geographic, der arbejder med et testfirma ved navn Helix - kunne være enige om, hvor Ashkenazi jeg er. [Hvordan fungerer DNA-Ancestry-tests virkelig?]

Tre virksomheder, tre fejl og seks forskellige resultater

AncestryDNA

AncestryDNA kiggede på den første DNA-prøve, der sendes ind for mig og rapporterede tilbage, at jeg er 93 procent "europæisk jødisk." Resten af ​​min aner, antydede det, er som følger: 2 procent spor tilbage til den iberiske halvø (det er Spanien og Portugal); 1 procent sporer tilbage til det "europæiske syd"; 1 procent sporer tilbage til Mellemøsten; og resten kommer fra andre steder.

(Billedkredit: Ancestry)

Den anden prøve frembragte lignende - dog interessant, ikke identiske - resultater. Denne bit af Rafi-spytte-i-et-rør, rapporterede den, var kun 92 procent Ashkenazi, men hele 3 procent iberisk. Resten af ​​DNA'et kan ifølge Ancestry have sporet tilbage til Mellemøsten og det europæiske syd eller andre regioner. Men hver af disse kilder tegnede sig for højst under 1 procent af mit DNA ifølge webstedet.

(Billedkredit: Ancestry)

(sendte en tredje prøve af mit DNA til Ancestry under et tredje navn, men en fejl forhindrer os i at få adgang til resultaterne.)

AncestryDNA Genetisk testAmazon $ 59Vis Vi tjekker over 130 millioner produkter hver dag for at finde de bedste priserVis alle tilbud

23andMe

Ligesom AncestryDNA konkluderede 23andMe fra den første DNA-prøve, at min Ashkenaziness rangerer et eller andet sted i de lave 90'ere, med en bro mellem forskellen mellem hver af de prøver, den modtog. I modsætning til AncestryDNA havde den en ikke helt gammel tolkning af hvor mine forfædre måske er kommet fra - hvilket antydede, at en brøkdel af 1 procent af mine forfædre måske var indianer. (I betragtning af hvad jeg kender til min familiehistorie, er dette næsten bestemt ikke sandt.)

23ogMe DNA-testAmazon $ 99Visning Vi tjekker over 130 millioner produkter hver dag for at få de bedste priserVis alle tilbud

Mens jeg rapporterede om denne historie, opdaterede 23Me imidlertid sit system til fortolkning af DNA-prøver og revurderede alt det DNA, der allerede var i sit system. Nu, når jeg logger ind på 23ogMe ved hjælp af de tre forskellige navne, jeg gav, siger rapporterne for to af disse navne, at jeg har 100 procent Ashkenazi-aner. [De bedste DNA-testsæt i 2018]

(En tredje prøve sendt til 23andMe har ikke returneret nogen resultater. Tildelte en kvindes navn til en af ​​prøverne, som den sendte til hvert selskab og markerede sin køn som kvindelig. AncestryDNA behandlede sin "kvindelige" prøve helt fint uden indikation af noget uventet , men både 23andMe og Nat Geo krævede mere personlig information, før de fortsatte, da det var fra en person med uventede kromosomer.)

(Billedkredit: 23andMe)

Nat Geo og Helix

Endelig er der Nat Geo, der bruger en tjeneste kaldet Helix til at udføre sin DNA-test. Helix håndterer den rå DNA-behandling, mens Nat Geo håndterer fortolkningen.

I følge Nat Geo er jeg langt mindre end 100 procent Ashkenazi. Den genetiske tjeneste rapporterede, at min første prøves aner var 88 procent fra den "jødiske diaspora" (i denne sammenhæng, et udtryk, der mere eller mindre refererer til Ashkenazim) og 10 procent fra "Italien og Sydeuropa."

(Billedkredit: Nat Geo)

Nat Geo rapporterede også den største forskel mellem dens to succesrige prøver, og rapporterede, at den anden prøve, den modtog, var 3 procent mindre "jødisk diaspora" end den første - kun 85 procent. Resten var denne gang 13 procent "Italien og Sydeuropa."

(Billedkredit: Nat Geo)

Så ni DNA-prøver senere lærte jeg dette om mig selv: Jeg er en hel del askenazisk jødisk. Som det meste. Eller helt. Resten af ​​mine forfædre i nyere hukommelse boede sandsynligvis også i Europa - men hvem ved virkelig hvor. Og måske et sted i mit slægtstræ var der en mellemøstern eller en indianer. Men sandsynligvis (næsten bestemt) ikke.

Men selvfølgelig vidste jeg allerede alt det.

Videnskaben

Forskere, der specialiserer sig i denne form for forskning, fortalte, at intet af dette er så overraskende, skønt de bemærkede, at det faktum, at virksomhederne ikke engang kunne producere konsistente resultater fra prøver, der blev taget fra den samme person, var lidt underligt.

"Ancestry i sig selv er en sjov ting, idet mennesker aldrig har været disse forskellige grupper af mennesker," sagde Alexander Platt, ekspert i befolkningsgenetik ved Temple University i Philadelphia. "Så du kan ikke rigtig sige, at nogen er 92,6 procent stammende fra denne gruppe mennesker, når det ikke rigtig er noget."

Log på et websted som Nat Geo's, og det klumper verden op i forskellige stykker. Nogle af dine forfædre kom fra dette sted, siger det, og de var centralasiatiske. Andre kom derfra, og de var Mellemøsten. Men det er ikke, hvordan menneskets historie ser ud. Befolkninger brusede sammen. Folk bevæger sig rundt, mødes og skilles. En person, der i dag kalder sig en italiensk, har måske kaldt sig en målmand for et par tusind år siden og gået i krig mod romerne.

For at opdele mennesker i grupper, fortalte Platt, fortalte forskere beslutninger: F.eks. Siger de, medlemmerne af denne gruppe af mennesker har alle boet i Marokko i mindst flere generationer, så vi tilføjer deres DNA til referencebibliotekerne for marokkanere. Og folk, der havde en bedsteforælder med den slags DNA, vil høre, at de er 25 procent marokkanske. Men den grænse, sagde Platt, er grundlæggende "imaginær."

”Der er struktur i historien,” sagde han. "Visse folk er nærmere knyttet til hinanden end andre folk. Og [kommercielle DNA-virksomheder] forsøger at skabe grænser inden for disse klynger. Men disse grænser eksisterede aldrig rigtig, og det er ikke rigtige ting."

Nogle steder er dette lettere. Ikke-jødiske europæiske befolkninger, sagde han, havde en tendens til ikke at blande sig lige så meget med andre som mennesker andre steder i verden, så virksomheder let kan foretage finere sondringer mellem dem.

Men i sidste ende betyder det ikke noget at være 35 procent irsk eller 76 procent finsk. Så når 23andMe skiftede mening om min aner, var svaret på 100 procent ikke mere sandt. Det var bare en anden måde at fortolke dataene på.

(I dette tilfælde, sagde Platt, har virksomheden sandsynligvis besluttet, at da næsten alle Ashkenazi-jøder har nogle gener til fælles med en blanding af andre europæiske befolkninger, er det fornuftigt at kalde disse gener også Ashkenazi.)

”Det er ikke rigtig videnskab så meget som det er beskrivelse,” sagde han. "Der er ikke rigtigt et rigtigt eller forkert svar her, fordi der ikke er nogen officiel betegnelse på, hvad det betyder at være Ashkenazi jødisk genetisk."

Det er ikke rigtig underligt for ham, at der er en 15 procent jødelighedskløft mellem mine resultater i Nat Geo og i 23ogMe, sagde han.

(Billedkredit: Rafi Letzter /)

Mark Stoneking, en befolkningsgenetiker og gruppeleder ved Max Planck Institute for Evoluntionary Anthropology i Leipzig, Tyskland, var enig.

"Hvis de skulle være helt ærlige, er det, de skulle fortælle dig, ikke, at du er 47 procent italiensk, men at du er 47 plus eller minus et eller andet fejlområde ... baseret på deres evne til at skelne mellem denne herkomst og andre fejlkilder, som gå ind i estimatet, ”fortalte Stoneking .

Og det er klart, at der er fejlkilder, sagde han. Hverken Stoneking eller Platt var sikker på nøjagtigt, hvorfor AncestryDNA havde en forskel på 1 procent mellem dets resultater for forskellige prøver, eller Nat Geo havde en forskel på 3 procent, eller 23andMe havde vriket rum, der forsvandt med opdateringen. Men de var enige om, at det sandsynligvis har noget at gøre med deres metoder til at konvertere et hætteglas med spytte til data, som computeren kan fortolke. (bad alle tre virksomheder om at forklare spørgsmålet, men ingen gav et specifikt svar.) [Genetics: The Study of Heredity]

Hver af disse virksomheder, sagde Stoneking, opdeler DNA'et i spytteprøven i alleler - genetiske markører, som de bruger som rå data. Men denne proces er ufuldkommen og fungerer helt klart ikke på samme måde, hver gang virksomhederne kører resten, sagde han - selvom fejlene ikke er meget betydningsfulde.

Skulle du få testet dit DNA?

Intet af dette betyder, at et forfædresæt fra 23andMe eller AncestryDNA eller Nat Geo er værdiløst, er Stoneking og Platt enige om.

”Jeg betragter disse ting som mere til underholdning end noget andet,” sagde Stoneking.

Den reelle videnskab om populationsgenetik, forklarede han, bruges til at finde ud af, hvordan store grupper af mennesker bevægede sig og blandede sig over tid. Og det er godt til det formål. Men at finde ud af, om 3 til 13 procent af mine forfædre kom fra den iberiske halvø eller Italien, er ikke en del af dette projekt.

Platt sagde, at han havde fået sig selv kommercielt testet, og at selvom han ikke havde fundet noget overraskende, er det altid muligt for nogen at lære noget nyt og interessant - især hvis de er af ikke-jødisk europæisk herkomst og vage på detaljerne. En hvid ikke-jøde lærer måske noget specifikt og interessant om deres baggrund, fordi deres forfædre sandsynligvis kommer fra stærkt isolerede referencepopulationer, som virksomhederne har masser af data på. Men folk fra andre steder har lavere odds, simpelthen fordi dataene fra andre steder er mere begrænsede, uklar og vanskelige at fortolke.

Da jeg kontaktede virksomhederne og bad dem kommentere denne historie og behandle spørgsmålet om, hvorfor mine resultater kan have været forskellige - selv når testen blev udført af det samme firma - svarede både Ancestry og 23andMe.

Her er hvad Ancestry sagde:

"Vi er sikre på videnskaben og de resultater, som vi giver kunderne. Forbrugergenomikindustrien er i sine tidlige stadier, men vokser hurtigt, og vi fortæller kunderne gennem hele oplevelsen, at deres resultater er så nøjagtige som muligt for hvor videnskaben er i dag, og at det kan udvikle sig over tid, efterhånden som opløsningen af ​​DNA-estimater forbedres [vi]. Vi vil altid arbejde for at udnytte udviklingen inden for videnskaben for at forbedre vores kunders oplevelse. F.eks. tillader den seneste udvikling inden for DNA-videnskab os at udvikle en ny algoritme, der bestemmer kundernes etniske sammenbrud med en højere grad af præcision. "

Og her er kommentaren fra 23andMe, som repræsentanten anmodede om attribut til Robin Smith, en ph.d. der har titlen som gruppeprojektleder hos virksomheden:

"Vores forfædrerapporter er en levende analyse og er i konstant udvikling, og når vores database vokser, vil vi være i stand til at give kunderne mere detaljerede oplysninger om deres forfædre og etnicitet. Vi forbedrer konstant både vores referencerat og de overordnede vi bruger til at beregne kunders Ancestry Composition-rapporter. Faktisk har vi for nylig rullet en omfattende opdatering af forfader tidligere på året, hvilket øger de lande og regioner, vi rapporterer om - for at give mere dybdegående information til befolkninger, der er underrepræsenteret i studiet af genetik.

"Med hensyn til de Ashkenazi-referencepopulationer er vores præcision for at kalde AJ [Ashkenazi jødisk] aner, faktisk forbedret fra 97 procent til 99 procent i løbet af de sidste to år af disse grunde. datasæt, hvor meget kalder vi AJ er forbedret til 97 procent, op fra 93 procent for to år siden.

"Der kan være uoverensstemmelser på tværs af DNA-stamprøver på grund af forskellige algoritmer og referencepaneler, der er forskellige i nøglehensyn."

Nat Geo svarede ikke på flere anmodninger om kommentar inden pressetid.




Endnu ingen kommentarer

De mest interessante artikler om hemmeligheder og opdagelser. Masser af nyttige oplysninger om alt
Artikler om videnskab, rum, teknologi, sundhed, miljø, kultur og historie. Forklare tusinder af emner, så du ved, hvordan alt fungerer